Login lub e-mail Hasło   

Topoizomerazy, czyli jak powstaje superhelikalna struktura DNA

Topoizomerazy to enzymy, dzięki którym w komórce może zmieścić się bardzo długa cząsteczka DNA...
Wyświetlenia: 6.685 Zamieszczono 03/12/2009

Ogólnie

(ogólne informacje zaczerpnąłem z Wikipedia.pl i uzupełniłem je - również na portalu Wikipedia.pl edytowałem to hasło)

Topoizomerazy – grupa enzymów konwertujących energię chemiczną pochodzącą od ATP w energię torsyjnego napięcia cząsteczki o superhelikalnej strukturze. In vivo topoizomerazy rozplatają podwójną helisę DNA, udostępniając w ten sposób matrycę dla enzymów replikacyjnych lub transkrypcyjnych. W zależności od ilości rozrywanych jednorazowo wiązań fosfodiestrowych wyróżniamy:

  • topoizomerazy I – hydroliza jednego wiązania – nacięcie jednej nici, odpowiada za usuwanie (relaksacja) z cząsteczki DNA superskrętów.
  • topoizomerazy II – hydroliza dwóch wiązań – nacięcie obu nici, odpowiada za dodanie do cząsteczki DNA superskrętów.

 

Reakcje usunięcia i dodania superskrętów do cząsteczki DNA.

1. Relaksacja:

  • Cząsteczka DNA wiąże się z centrum aktywnym topoizomerazy I; grupa hydroksylowa -OH tyrozyny 723 wchodzi w reakcję z grupą fosforanową jednej z nici DNA, tworzy się wiązanie fosfodiestrowe między enzymem i DNA – następuje rozerwanie (rozcięcie) jednej z nici helisy.
  • Cząsteczka DNA odwraca się wokół nieprzeciętej nici. Taka rotacja usuwa superhelikalne skręty w cząsteczce.
  • Wolna grupa hydroksylowa -OH cząsteczki DNA wchodzi w reakcję z grupą fosfotyrozynową w skutek czego przerwana nić DNA zostaje połączona.
  • Topoizomeraza I odłącza się od cząsteczki DNA.

źródło: http://www.mun.ca/biochem/courses/3107/images/ARB70_topoI_mechanism.jpg

 

2. Dodanie superskrętu:

  • Cząsteczka DNA wiąże się z centrum aktywnym topoizomerazy II, tworząc kompleks.
  • Kompleks topoizomeraza II / cząsteczka DNA (segment G) wiąże się słabo z innym fragmentem DNA (segment T) za pomocą domen.
  • Po dostarczeniu energii w postaci ATP następuje rozerwanie obu nici segmentu G.
  • Segment T zostaje przemieszczony za pomocą domen (białek składowych cząsteczki) topoizomerazy II przez pęknięcie segmentu G.
  • Pęknięte nici segmentu G zostają na nowo połączone.
  • Topoizomeraza II otwiera domeny (segment G pozostaje związany z enzymem) i jest gotowa do związania kolejnego segmentu T.

Źródło: http://www.mun.ca/biochem/courses/3107/images/VVP/Ch23/23-14.jpg

 

Bibliografia:

Berg, Tymoczko, Stryer: Biochemia; wyd. 4.; Wydawnictwo Naukowe PWN; Warszawa, 2009

Podobne artykuły


11
komentarze: 172 | wyświetlenia: 385
10
komentarze: 2 | wyświetlenia: 1056
10
komentarze: 14 | wyświetlenia: 1540
6
komentarze: 48 | wyświetlenia: 586
6
komentarze: 55 | wyświetlenia: 2253
5
komentarze: 62 | wyświetlenia: 952
124
komentarze: 52 | wyświetlenia: 141685
118
komentarze: 23 | wyświetlenia: 239150
91
komentarze: 20 | wyświetlenia: 110590
90
komentarze: 29 | wyświetlenia: 122078
 
Autor
Artykuł

Powiązane tematy






Brak wiadomości


Dodaj swoją opinię
W trosce o jakość komentarzy wymagamy od użytkowników, aby zalogowali się przed dodaniem komentarza. Jeżeli nie posiadasz jeszcze swojego konta, zarejestruj się. To tylko chwila, a uzyskasz dostęp do dodatkowych możliwości!
 

© 2005-2018 grupa EIOBA. Wrocław, Polska